首先，我们要选取合适的消毒剂，毕竟处理的物品不一样，所产生的污物也就不一样，如粪便一类的污物就需要偏杀菌一类的消毒剂，食品一类的污物则需要偏去油一类的消毒剂。可是无论怎样的材质，我们都不可以选取对机体有腐蚀刺激性的消毒剂。
      选好消毒剂后，我们就可以开始设备的清洁工作了，因为固液分离机机体内没办法储存水分，因此我们要先将设备的出水口堵住，随后向设备中注入约四分之一容积的清水，并按比例添加消毒剂，静置5-10分钟后启动设备让其处在正常的运行状态，以保证机体内每一个位置都有被清洁到，约2-3分钟后关闭设备，待其静置10分钟后将水排出，随后重复这一方法，通常循环三次左右，从固液分离机中排出的水便是无色无味的了，这样就算是清洁完成了。在清洁完成后我们需要用抹布将机体的水擦洗干净，并开启设备的桶盖，让其自然风干，以防产生异味。
      上述清洁方式，不但能够确保我们应用固液分离机时的卫生性，还能延长其的使用期限，可谓是一举两得。